lncRNA測序

簡要描述：lncRNA測序：長鏈非編碼RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）一般是指長度大于200 nt的RNA，位于細胞核內或胞漿中，不參與蛋白質編碼功能，以RNA形式在多種層面上（表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等）調控基因的表達水平，在生命活動中具有重要作用。

更新時間：2022-12-22
瀏覽次數(shù)：2203

產品咨詢聯(lián)系我們

產品分類

實驗

染色實驗動物實驗分子實驗病理實驗細胞實驗基因測序蛋白實驗動物模型抗體定制實驗科研實驗檢測實驗查看全部產品

詳細介紹

lncRNA測序

長鏈非編碼RNA測序（long non-coding RNA sequencing，lncRNA-Seq）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA 的豐度，對富集到的 RNA進行文庫構建，再對高通量測序儀產出的數(shù)據(jù)進行信息分析的研究方法。lncRNA-Seq可一次性獲得樣本中大部分的lncRNAs信息，對lncRNAs的類別、功能進行深入分析，從而快速準確地獲得與特定生物學過程（例如發(fā)育、**等）相關 lncRNA信息。

數(shù)據(jù)分析內容

標準分析項目

1) 去除接頭序列、低質量序列，得到高質量數(shù)據(jù)；

2) 與核糖體數(shù)據(jù)庫比對，去除核糖體RNA（rRNA）數(shù)據(jù)

3) 轉錄本組裝；

4) 鑒定已知轉錄本（包括已知lncRNA）和新轉錄本；

5) 預測新的lncRNA；

6) lncRNA定量及差異分析（需至少2個樣品）；

7) lncRNA差異表達模式聚類；

分析項目

基于互補序列的lncRNA-mRNA互作分析；

構建重要的lncRNA-mRNA網(wǎng)絡圖；

網(wǎng)絡拓補學分析及網(wǎng)絡模塊分析；

功能富集分析；

ceRNA預測分析；

lncRNA測序樣品要求

1.樣品類型：細胞、新鮮組織或RNA樣品。

2.樣品量：細胞樣品請?zhí)峁┲辽?×107個細胞，組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片，RNA樣品請?zhí)峁?0 μg以上的總RNA。

3.樣品質量：RNA無明顯降解，提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間，濃度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥7。

4.樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊（切成~50mg的小塊）可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后，-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。

5.樣品運輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰運輸。

產品咨詢

留言框

產品：
您的單位：
您的姓名：
聯(lián)系電話：
常用郵箱：
省份：
詳細地址：
補充說明：
驗證碼：

請輸入計算結果（填寫阿拉伯數(shù)字），如：三加四=7

国产久久久久久久久久久,国产精品虐无码一区二区,蜜臀久久久久久久久免费,欧美 日韩 亚洲 av

lncRNA測序

留言框

產品：

您的單位：

您的姓名：

聯(lián)系電話：

常用郵箱：

省份：

詳細地址：

補充說明：

驗證碼：

国产久久久久久久久久久,国产精品虐无码一区二区,蜜臀久久久久久久久免费,欧美日韩亚洲 av